山东省食品发酵工业研究设计院创建于1963年，是山东省唯一的集食品发酵工程技术研究、检测、设计为一体的综合性专业研究开发单位。近20多年来，在传统食品、保健食品、农副产品深加工、新型发酵、传统发酵、香精香料研究领域部分研究方向一直处于全国领先地位，单位主要职能是为企业提供技术转让、技术服务、工程设计、产品质量监督检测、人才培养、产学研合作共建工程技术研究平台等。
主要机构：
山东省食品发酵工程重点实验室
山东省食品发酵研究所
山东省食品发酵工程设计所
山东省食品质量监督检验站
国家轻工业食品质量监督检验济南站（行业大区站）
济南九州富得香精香料责任有限公司
山东省轻工科技信息中心
京鲁生物技术研究中心
《山东食品发酵》编辑部
山东省食品发酵工程行业技术中心（合作）
山东省研究生联合培养基地
山东省饮料行业协会秘书处
山东省乳制品工业协会秘书处
山东省制冷学会秘书处
山东微生物学会工业微生物专业委员会
全院共有职工140人，其中专业技术人员占90%，其中二级岗位研究员3名，享受国务院特殊津贴8名，山东省有突出贡献的中青年专家3名,山东省青年科技奖获得者2名，获山东省轻工科技拔尖人才20名，1人被山东省人民政府授予山东省优秀专业技术人员称号（十佳）、1人获得新世纪百千万人才工程国家级人选。目前与高校联合培养博士、硕士研究生50人，在读博士、硕士研究生35人。
近年来，先后完成了国家科技支撑计划十余项，省部级计划课题百余项，企业委托科研课题几百项，多数成果达到了国际先进和国内领先水平，部分达到国际领先水平，并成功转化，实现了工业化生产。先后率先将“果葡糖浆、黄原胶、衣康酸、人工培养冬虫夏草、赤藓糖醇、D-核糖、天然乳香香味剂、低聚木糖、木聚糖 、低聚麦芽糖、木糖（醇）、普鲁兰糖、可得然胶、韦兰胶、葡萄糖酸钠”等生物发酵制品以及一系列果蔬精深加工产品如“浓缩枣汁等红枣系列产品的深加工、山楂系列产品的深加工、水果蔬菜粮食发酵饮料、芦笋下脚料综合利用、莲藕深加工技术”等推向产业化，创造了巨大的社会经济效益。获得国家和省部级科技进步奖68项，其中获国家科技进步二、三等奖4项，省部级科技进步二等奖以上奖励30多项，发明专利40多项。